一种存储系统中的快照处理方法，存储系统中的一对控制器快照下电时，将快照控制信息保存在指定位置；在控制器上电时，首先控制器分别检查各自的控制器状态；然后根据控制器状态或对端控制器要求初始化快照程序；再根据需要设置是否处理所述指定位置保存的数据，以及是否镜像指定位置数据的标志位；并根据所设置的标志位读取和镜像指定位置的数据；开始快照，快照开始后，控制器可以开始接收主机请求命令。本发明在当存储系统突然掉电后，可以将源卷在某个时间点的快照数据保存下来，以便系统重新上电后，快照能够继续，保证了存储系统中数据的安全。