本发明提供了一种高硅铝比小晶粒NaY分子筛的制备方法，采用非模板剂直接合成的方法制得。具体的步骤为：预先在15～60℃下搅拌陈化0.5～48小时制得晶化导向剂，然后将导向剂、水、硅源、铝源制成反应混合物，搅拌均匀后将反应混合物分两步晶化，第一步动态晶化：温度控制在20～80℃，晶化时间为0.5～24小时；第二步静态晶化：温度控制在90～140℃，晶化时间为5～100小时，最后经过滤、洗涤、干燥，制得相对结晶度大于80%的高硅铝比小晶粒NaY分子筛。该分子筛具有良好的结构稳定性和催化活性，制备方法的原料易得、无环境污染，具有工业应用前景。