本发明提出了一种PCI选项ROM程序的驻留方法，包括在BIOS上电自检过程中执行以下步骤：将整个PCI选项ROM程序复制到系统存储器的阴影空间中并运行；在运行结束后，将选项ROM程序运行后留下的PCI选项ROM运行时间程序移动到系统存储器的其他存储区域；记录PCI选项ROM运行时间程序的存储地址与相应设备之间的对应关系；在阴影空间中驻留代理程序；以及将已记录的对应关系驻留在阴影空间中。本发明还提出了一种与上述PCI选项ROM程序的驻留方法相对应的、PCI选项ROM程序的调用方法。