本发明公开了一种含有粉防己碱的眼用制剂及其在制备治疗眼科疾病的粉防己碱眼用制剂中的应用，属于含异喹啉衍生物类有机有效成份的医药配置品及其用途。本发明包括含有粉防己碱的眼用制剂的液体或膏体赋型剂，其粉防己碱的重量百分比含量为0.001-2%，合用药物0-5%，赋型剂为93-99.999%。适用于眼科疾病中的眼炎症、手术后眼炎症、过敏性眼疾病、降眼压治疗青光眼及抑制瘢痕形成治疗术后青光眼、后发白内障、视网膜玻璃体增殖性病变。本发明与已有技术的眼科疾病用药比较，具有疗效高，副作用小的优点。