一种治疗锥体虫病的药物，其特征是本药物的有效组分青蒿素或其衍生物和喹宁类衍生物的重量比为1-20∶1-10。本发明的药物将具有协同作用的青蒿素衍生物与喹宁类衍生物共同使用，可产生比两者单用更好的效果，并在较低药物浓度中短时间内可杀死体外培养中的布氏锥体虫。试验对青蒿素衍生物、喹宁类衍生物单独使用与两药合用于体外培养的布氏锥体虫杀死作用的效果进行了比较，结果布氏锥体虫在含有浓度低于≤0.1mg/ml的青蒿琥酯的培养液中连续培养10天未见死亡，而在含有青蒿琥酯和磷酸氯喹药物浓度各为0.1mg/ml的培养液中培养18小时即已经全部死亡。