本发明涉及一种连续运行强化生物膜除磷的装置和方法，由进水箱、中间水箱、生物滤池三部分组成，可实现连续式生物除磷。生物滤池采用厌氧/好氧交替式附着生长体系，采用石英砂作为生物载体，在其表面形成由聚磷菌、普通异养菌以及硝化菌、反硝化菌形成的混合菌群生物膜，利用可调式时间程序控制反应器进、出水方向，以及反应器与大气的接通，使生物膜交替循环暴露于厌氧/好氧环境中，利用聚磷菌在厌氧释磷-好氧吸磷的循环交替中去除废水中的磷，该系统也可同时脱氮、去除废水中的有机物。