本发明提供一种从雨生红球藻中超临界提取虾青素的方法，利用超临界CO2萃取工艺提取虾青素，设定萃取釜的温度为30-50℃，压力为20-30MPa，CO2流体的流速为20-40L/h，萃取时间为2-4h。虾青素具有最强的抗氧化性，容易被氧化。本发明的提取方法简单、快速、操作方便；萃取过程中所用的提取溶剂为CO2，使生产过程绿色环保，提取物无有机溶剂残留；萃取过程中温度较低，可以有效的避免有效物质高温分解；获得的虾青素提取物，为暗红色粘稠状物质，能够较好的保留有效物质，可用于保健食品开发或作为药用成分的原料。