一种制备组织工程角膜的方法，本发明采用羊膜上皮干细胞和间充质干细胞为种子细胞，经体外诱导分化后种植在脱细胞天然角膜基质的两面，再经体外器官培养形成组织工程角膜；本发明所用支架既克服了异种角膜基质免疫排斥大的难题，又保留了天然角膜的结构(能够恢复角膜的透明度)和主要成分(包括能促进角膜细胞生长、增殖和分化的生长因子)；与现有技术产品相比，本发明具有成本低、操作简便、来源广泛和易于贮存的优点；其含有活细胞的组织工程角膜有一定的弹性和韧性，形状大小和厚度易于改变，免疫原性极低；能避免非角膜材料引起的并发症，植入体内可被受体细胞所改建，能迅速与机体整合实现透明，适用于修复各种原因导致的角膜损伤。