通过使用一个或者多个反应物对微粒进行定序反应、在激励图案中有选择地激励微粒、以不足以分辨个别微粒的分辨率对微粒进行光学成像以及使用与激励图案有关的信息来处理微粒的光学图像以确定光学签名的存在或者不存在(这表明核酸的序列信息)来对核酸微粒进行定序。一种用于微粒的光学激励的装置包括递送第一激光束的光纤和耦合到光纤的干涉图案生成模块。干涉图案生成模块将第一激光束拆分成第二激光束和第三激光束并且通过第二激光束与第三激光束之间的干涉来生成用于有选择地激励微粒的激励图案。