本发明属于生物医药技术领域，涉及密码子优化的HIV-1gp120基因共有序列及gp120核酸疫苗。本发明应用多序列比对分析，获得中国HIV-1流行病毒株(A/E重组亚型、B/C重组亚型和ThB亚型)包膜蛋白gp120共有氨基酸序列；应用人工合成的方法制备编码共有氨基酸序列的gp120基因片段，该基因经密码子优化，兼顾了哺乳动物细胞和大肠杆菌密码子使用偏好；在此基础上，构建了由gp120基因和真核表达载体pJW4303组成的HIV-1gp120核酸疫苗。该核酸疫苗可以应用于动物和人体免疫，也可以应用于gp120蛋白的表达和生产。