本发明涉及生成USIM卡中菜单的方法和系统，方法包括：步骤1，USIM卡依据OTA大类ID分组，为每个分组预留菜单入口项；步骤2，Java应用服务器为Java应用计算位置序号，向USIM卡安装指令；步骤3，OTA应用服务器依据OTA应用规范向USIM卡发送命令；步骤4，USIM卡依据接收到的命令中的OTA大类ID判断命令中OTA大类所属分组，在分组内对OTA大类进行对应操作，依据接收到的Java应用的安装指令中的位置序号将Java应用插入到相应分组间；对菜单入口列表中状态为启用的菜单入口项组织菜单建立命令，生成菜单。本发明能够在USIM卡中完成对Java应用菜单和OTA应用菜单的相互兼容。