描述了使用粉末状、粒状或挤压的吸附剂的快速、经济环保、绿色的连续纯化生物柴油(脂肪酸烷酯(FAAE))的方法。所述吸附剂被包含在柱系统中并可再生重复利用多次。所述方法利用包含在柱中的吸附剂诸如但不限于碳、二氧化硅、粘土、沸石或金属硅酸盐以连续的工艺从脂肪酸烷酯(FAAE)或原生物柴油除去杂质。该方法使用吸附柱系统来纯化生物柴油，而非用水或过滤来纯化，将存在于生物柴油中的皂类和其它杂质除去。原生物柴油与填充到柱中或串联的多个柱中的吸附剂接触足够长的时间，除去杂质，诸如但不限于皂类、金属、游离的甘油、甾醇糖苷和许多其它的降低生物柴油稳定性的杂质。得到的成品生物柴油从柱排出，准备进行甲醇回收工艺。一旦吸附剂不再除去期望量的杂质，将其再生以重复利用。通过将用于再生方法的溶剂循环回酯交换反应来再生和再利用。