本发明涉及一种基于工频载波的分布式发电孤岛检测系统及其检测方法，该系统包括配置在终端配电变电站附近的工频载波信号生成装置，配置在分布式电源并网处的工频载波信号检测装置；工频载波信号生成装置通过一台信号耦合变压器连接到变电站母线上；工频载波信号生成装置通过A相、B相、C相火线和N中线接到信号耦合变压器上，信号发送可以实现任意单相发送、任意两相并行发送和三相并行发送；工频载波信号检测装置通过A相、B相、C相火线和N中线接到低压电网上。基于工频载波的分布式发电孤岛检测系统实施成本低，检测方法满足相关标准要求。本发明为分布式发电并网及为电网中的孤岛信号检测、反孤岛保护提供了一种有效的方法，在分布式发电在配电网中渗透率高的情况下应用具有非常高的技术经济性能。