本发明涉及一种将图像的第一序列与第二图像的第二序列进行时间配准的方法，包括：a)将第一图像的签名的第一部分与第二图像的签名的相应部分进行比较(10)，b)根据比较结果，将每个第一图像与第二图像中的一个进行时间配准(12)，c)针对每个第一图像，计算(14)代表其配准质量的质量值，d)针对质量值小于阈值的每个第一图像，定义(16)第一序列的第一子序列和第二序列的第二子序列，e)针对每个第一子序列，将所述第一子序列中所述第一图像的签名的第二部分与相应第二子序列中所述第二图像的签名的相应部分进行比较(18)以及f)根据比较结果，将第一子序列的每个第一图像与第二子序列的第二图像中的一个进行时间配准(20)。