本发明公开了一种对动态口令令牌中种子的更新方法，首先用户使用动态口令令牌和服务端进行互相认证，如果全部合法，则可以对动态口令令牌中的种子进行更新，所述服务端生成种子更新标识，并将种子更新标识发送给客户端，所述动态口令令牌使用所述种子更新标识生成临时种子，并使用临时种子再次进行动态口令的认证，如果认证成功，则对其内部存储的种子进行更新，服务端也更新其为所述动态口令令牌存储的种子，通过对动态口令令牌中的种子进行更新，可以防止令牌生产商知悉每个令牌中种子的情况，增加了安全性。