本发明公开一种S1切换中业务准备失败的处理方法，在核心网向目的侧eNB发送的Handover Request消息中增加核心网准备失败业务列表的信元，目的侧eNB根据Handover Request消息生成RRC重配消息并经核心网发送给源侧eNB，源侧eNB便可以根据RRC重配消息配置UE删除其上核心网准备失败业务列表中的业务。本发明还公开一种S1切换中业务准备失败的处理系统，由于在Handover Request消息中增加了核心网准备失败业务列表的信元，所以本发明可以使UE删除其上核心网准备失败业务列表中的业务，从而保证UE的业务同网络侧的业务保持对齐，避免UE掉话，提高系统S1切换的成功率。