本发明公开了一种复杂油藏水淹状况监测系统，包括：输入单元，用于输入井点地质参数；多级处理单元，用于根据输入单元输入的所述井点地质参数建立隐含的地质特征参数，完成区块多层、多井、多相及多种驱动力的能量平衡分析计算，进一步建立井间注采对应关系；利用拟函数，对分层分区水淹状况进行综合反演处理，得到区块和单井不同时期的各种产吸剖面、分层水淹状况分布情况数据；显示单元，用于显示所述多级处理单元建立的井间注采对应关系，以及得到的区块和单井不同时期的各种产吸剖面、分层水淹状况分布的图形结果数据。本发明可得到准确的分层水淹状况数据和不同级别的剖面分析结果数据，能提高开采时的精度，节省人力物力。