本发明公开了可打水泥塞的深水弃井切割装置及其打水泥塞作业方法，该装置的旁通短接本体上设置中心水眼和旁通孔；活塞件设置在中心水眼与旁通孔的连接处，上连通管与芯轴形成与旁通孔连接的上导流通道；活塞件上设置连通中心水眼与芯轴中心孔的过孔；堵塞件设置在过孔上，阻断中心水眼与芯轴中心孔的连通，在钻井液的压力下移动活塞件，导通中心水眼与旁通孔；在单向旁通接本体上设置短接水眼和单向旁通孔；下连通管与螺杆马达承力座形成与单向旁通孔连接的下导流通道；第一单向阀设置在短接水眼上；在单向旁通孔中设置有第二单向阀。从而实现了由同一装置完成切割、打捞和注水泥的作业，提高了深水钻探的作业效率，也降低了深水钻采的成本。