一种集胞藻PCC6803表达外源基因的方法，包括：1)分别将集胞藻6803的rbcL启动子(Prbc，1.3kb)和终止序列rbc terminator(Trbc，0.2kb)，2kb的壮观霉素抗性标记基因Ω，以及报告基因lacZ构建于一个集胞藻6803基因组整合质粒平台，得到已经包含报告基因的用于集胞藻6803表达外源基因并可以基因组整合的平台质粒pFQ20；2)pFQ20转化集胞藻6803藻株，经壮观霉素抗性筛选得到转化子，用特异引物PCR鉴定基因型后，测定转化了表达平台和外源基因的基因工程集胞藻6803藻株的β-半乳糖苷酶酶活，以验证集胞藻6803外源基因表达平台的表达效率。