本发明公开了一种以蓝藻为模板制备单分散羟基磷灰石的方法，其特征在于：其步骤为：1）将新鲜采集的蓝藻进行前期处理；2）将可溶性钙盐完全溶解于水和醇类溶剂的共混溶剂，然后将处理好的蓝藻加入到混合溶剂中，低速搅拌，常压下进行第一阶段渗透；3）将第一阶段渗透好的蓝藻用双蒸水洗涤三次，然后将含磷化合物的醇溶液加入第一阶段已渗透好的蓝藻中；低速搅拌，在常压下进行第二阶段渗透；4）将步骤3）反应产物用无水乙醇洗涤三次，然后放在干燥箱中干燥；再在马弗炉中煅烧，得白色单分散球状羟基磷灰石粉体。本发明具有高分散性和稳定性、成本低、过程简单易操作、产品纯度高及其形状规则、合成条件温和等特点。