一种燃料电池系统估算氢瓶氢气剩余压力的方法及装置，该方法是向氢气瓶内充气至压力值达到设定范围，求得氢气初始摩尔值；燃料电池运行时，测量电流值，求得运行时间内输出的总电量；从而计算消耗的氢气摩尔量，算得氢瓶剩余压力。该装置包括氢气瓶、燃料电池和燃料电池控制器，氢气瓶出口设有压力表，氢气瓶出口通过管路与燃料电池连接；燃料电池通过装有电流传感器的电流传输线输出电流；燃料电池控制器内存储氢气瓶满瓶状态下的压力值，燃料电池控制器还控制燃料电池的启闭，且采集电流传感器测得的电流值并对其进行处理计算及存储。本发明降低燃料电池系统的成本，减少燃料电池系统的复杂度和节约燃料电池整体的空间。