本发明涉及充电控制器技术，尤其涉及一种具有MPPT功能的大变比隔离型太阳能充电控制器，其包括有微处理器、PWM调制单元、开关管单元，还包括用于采样太阳能电池输出电压的第一电压采样电路、用于采样太阳能电池输出电流的第一电流检测电路、用于采样蓄电池电压的第二电压采样电路、隔离驱动电路、高频开关变压器；本发明可以实现“MPPT+SOC”的双重智能充电控制；而且，本发明可以避免当太阳能电池输出电压很高时而用户配置的蓄电池电压等级却很低时开关管被击穿事故以及热损坏事故的发生，因此，本发明适用于太阳能电池输出电压很高而蓄电池电压等级较低的太阳能发电系统，如非晶硅薄膜太阳能电池发电系统。