本发明公开了一种拓扑序列航迹相关算法的高效计算方法，属于多传感器组网航迹相关领域。该方法在拓扑序列法的基础上，首先发现了存在系统误差情况下，不同传感器的拓扑序列满足相似变换，然后提出利用互协方差矩阵奇异值分解来计算序列的相似变换参数，最后通过求得的相似性参数来检验航迹的相关性，把满足统计检验的拓扑序列判断为来自同一个目标。本发明方法避免了拓扑序列法的角度微调过程，在保证航迹相关性能的前提下，不但能大幅度减少计算时间一个数量级，还具有更高的传感器系统误差容忍能力。