本发明涉及一种多功能固态发酵反应器，包括主罐、辅助系统和控制中心；主罐上端口通过法兰将罐盖固定，罐盖的顶部固定圆筒接口；该圆筒接口上端面分别有4个接口，4个接口连接的管路分别通过阀门与气体净化模块、压力计、气体分析模块相连，第一接口的管路末端连接一四通，四通的一接口通过气体管道进入主罐，形成气体从第四接口到第五接口构成一个回路；辅助系统由无菌接种、循环气体、外源气体三个部分组成。在本发明的反应器内可以实现密闭、无杂菌污染和压力脉动的固态发酵过程，同时又可应用于固态有机物的快速腐熟过程，在发酵过程中可监测到各种参数，并提供了一种反应器内原位提取所需发酵产物的方法。