本发明涉及一种差别化聚酰胺纤维的制备方法，聚酰胺原料干燥后，经螺杆熔融和挤压并经纺丝箱体挤出，冷却吹风冷却后形成初生纤维，初生纤维经过一级拉伸和二级拉伸后卷绕而获得差别化聚酰胺纤维；熔融纺丝过程中，所述冷却吹风的风速由脉冲信号控制而按规律变化，所述的规律是指所述风速满足方程V(t)=S+sinωt。通过熔体挤出喷丝板下冷却风风速的程序化控制，也就是通过脉冲泵调节风速来制备出差别化凝聚态结构和形态结构的聚酰胺纤维。本发明是在聚酰胺熔融纺丝冷却成形的关键区域，采用风冷差别化的方法，解决了既能保证聚酰胺原丝成形、卷绕正常进行，又能保证聚酰胺纤维内在结晶取向的差别，聚酰胺纤维形态结构异形度和差别化的问题。