本发明公开了一种硅纳米线与有机功能化合物的复合物及其制备方法。该硅纳米线与有机功能化合物的复合物是按照包括下述步骤的方法制备得到的：1)将硅纳米线表面用HF溶液处理，得到处理后的硅纳米线；2)在无水且隔绝氧气的条件下，使所述处理后的硅纳米线与式I所示的含醇羟基的有机功能化合物进行反应，得到所述硅纳米线-有机功能化合物复合物；式I中，n为大于等于1的整数，R为具有荧光性质的功能基团。该方法简单易行，并可有效控制硅纳米线与有机功能基团之间的距离，是一种有效的构建硅纳米线-单层有机功能基团的方法。利用红外光谱对修饰后的硅纳米线表面进行分析，结果表明硅纳米线与有机功能基团之间是以Si-O-C方式键合。HO-(CH2)n-N＝CH-R(式I)。