本发明公开了一种图像数据处理系统，包括一图像输入模块、一位图产生模块以及一编码模块。图像输入模块接收一图像以及一机密信息，并依据图像得到至少一灰阶图像。位图产生模块耦接至图像输入模块，用以依据灰阶图像来产生一位图图像并依据位图图像以及灰阶图像，来产生一有序抖动区块截断编码图像，其中位图图像中的每一像素为黑或白点。编码模块耦接至图像输入模块以及位图产生模块，以依据位图图像以及机密信息，来产生一编码灰阶图像。其中，编码模块将灰阶图像分为多个图像区块，并由图像区块中找出黑点与白点个数相近的候选区块，由找出的候选区块中筛选出高频区块，再将机密信息随机藏入至高频区块中，以产生藏有机密信息的编码灰阶图像。