本发明提供了一种新型的棉籽营养品质的快速无损分析方法。包括以下步骤：1)选用具有代表性的棉花品种的整粒棉籽作为实验样品；2)使用近红外光谱仪采集整粒棉籽的近红外光谱数据，光谱扫描范围为800～2500nm；3)用国标方法精确分析棉籽中的营养品质；4)对近红外光谱数据进行预处理；5)光谱变量选择，消除无信息变量；6)使用多元校正方法，建立整粒棉籽的近红外光谱与整粒棉籽营养成分含量的校正模型；7)校正模型的性能评价；8)采集待测的整粒棉籽的近红外光谱数据，光谱数据预处理后用所构建的校正模型预测其营养品质。本发明分析速度快、不破坏样品、无需样品预处理、检测精度高、可同时分析棉籽中的多种营养品质成分，为棉花育种和棉花种子检验提供了方便、快捷、高效的分析方法。