本发明属于植物检疫技术研究领域。苹果牛眼果腐病菌分子标准样品，以苹果牛眼果腐病菌菌株提取高纯度DNA为原料制得，标准样品具有下述的理化性质：（1）形状：纯白色粉末状；（2）每管的含量5µg±0.5µg；（3）DNA纯度：OD260/280=1.8～2；（4）易溶于水，或TE（Tris-EDTA）缓冲液中。本发明苹果牛眼果腐病菌分子标准样品以苹果牛眼果腐病菌菌株为原料，通过特定条件大量培养，提取高纯度DNA，进行分装、冻干，得到苹果牛眼果腐病菌的分子标准品，理化性质优良，可采用特异性的引物通过PCR方法检测出，灵敏度达到10-4倍。经检测试验，该标准品DNA完整性、均匀性、稳定性好，可用于进出口检测中，作为阳性参照物质，提高检测结果的准确性。