本发明涉及一种膜污染分析与清洗装置及其控制方法，膜污染测试分析单元主要包括测试水箱、低压泵、微滤器、高压泵以及压力容器，所述测试水箱、低压泵、微滤器、高压泵以及压力容器通过管道依次连接成一循环系统；膜污染清洗单元主要包括清洗水箱、所述低压泵、所述微滤器以及所述压力容器，所述清洗水箱、所述低压泵、所述微滤器以及所述压力容器通过管道依次连接成一循环系统；待清洗和分析的膜元件放置在所述压力容器中，在所述压力容器的输入端和输出端分别设有一仪表电器系统。本发明实现膜清洗与性能测试一体化，并提供标准化数据分析体系，实现高效的膜清洗过程为膜清洗及维护提供全面系统的服务，并且能够实现。