本发明公开了青蒿bHLH转录因子及其编码基因与应用。本发明所提供的青蒿bHLH转录因子，是如下a)或b)的蛋白质：a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与青蒿素合成相关的由a)衍生的蛋白质。本发明将bHLH转录因子瞬时转化到青蒿植株内过表达，其所调控的青蒿素生物合成代谢中的关键酶表达量大幅度提高，可以用来生产青蒿素。本发明调控青蒿素合成的方法解决了原料的限制问题，且生产工艺简单，有利于青蒿素的大规模工业生产。