本发明公开了一种用鱼油制取生物柴油的方法，用鱼油作原料，通过碱催化制作生物柴油的方法，先用硫酸和甲醇溶液在50-55℃的温度下预处理鱼油，使鱼油的酸值降低到10mg KOH/g以下，然后在50-60℃的温度下，加入氢氧化钠、甲醇混合溶液，反应40-60min，然后迅速冷却，静置分层2-3h，回收下层甘油，上层液用蒸馏水洗至中性，再用15％无水硫酸钠干燥，离心分离即得黄色澄清透明的生物柴油产品。经用称重法和甘油测定法测定，用减催化法从鱼油制作生物柴油的转化率为95.5-97.5％，所制取的生物柴油的酸值为0.13mgKOH/g，密度为0.87，40℃时的动力粘度为6.5cSt，闪点为119℃。本发明能充分利用水产加工废弃资源，提供生物柴油，缓解能源矛盾，减少环境污染，该技术能四季生产、生产效率高。