本发明涉及一种基于骨架配准的时变点云重建方法及系统，该方法包括以下步骤：获取运动物体时变点云序列，并将点云序列分成多个帧；提取每帧点云序列中的曲线骨架；建立相邻帧之间曲线骨架的骨架结点的对应关系；根据所述曲线骨架的骨架结点的对应关系配准骨架序列；根据配准的骨架序列计算一致骨架序列；根据所述一致骨架序列提取运动数据，且根据所述一致骨架序列和运动数据配准并补全点云数据。上述基于骨架配准的时变点云重建方法及系统，采用提取的曲线骨架并建立骨架结点的对应关系，再计算得出一致骨架序列，根据一致骨架序列和运动数据配准并补全点云，重建了新的点云，该方法无需借助精确的网格模版，通用性较强。