本发明公开了一种基于电流平衡原理的智能变电站同杆双回线路选相方法，其特征在于,包括以下步骤:1)横向不平衡电流的计算：同时采集两回线路电流、电压信息,对同名相电流计算其不平衡量,并计算制动电流，作为不平衡量的参考值；2)故障初选：首先根据步骤1）中计算所得的不平衡电流及其对应的制动量的相对大小选出仅在一回线中存在的故障相别，然后根据选中相别的两回线电流方向及其相对大小确定该相对应的故障线路；3)综合选相：根据2）中故障初选的结果，结合未选中相的故障电流相位、幅值及故障回路零负序电流相位进一步选出同名跨线相。本发明在跨线故障时选相正确率大大提高。