本发明公开了一种混合结构内存的内存分配系统及方法，所述系统包括：具有PCM内存区域和DRAM内存区域的混合结构内存，内存区域容量查看模块，信息判断模块，以及内存分配模块。所述方法包括：查看所述混合结构内存各内存区域的剩余容量；若各内存区域都有剩余容量；则判断程序段信息的种类并将只读属性的程序段优先分配到PCM内存区域；将可读可写的程序段优先分配到DRAM内存区域；将程序运行中分配的堆和栈优先建立在DRAM内存区域；若两种内存区域中任一方容量没有剩余；则程序运行需要的内存全部占用另一方的内存区域资源。本发明将PRAM和DRAM按其自身特点进行管理使用，使得PRAM和DRAM的内存组合可以发挥更大的作用。