本发明公开了一种核电站DCS系统组态逻辑设计的测试方法和系统，其中测试方法包括以下步骤：将设计完成的待测试组态逻辑图导入选定的最小配置DCS系统；将选定的最小配置DCS系统与工程仿真工艺平台进行通讯连接；根据预先设定的测试进程，在最小配置DCS系统上运行待测试组态逻辑图，并与工程仿真工艺平台进行数据交互，记录测试结果；根据测试结果修改待测试组态逻辑图。本发明采用最小配置DCS系统及工程仿真工艺平台进行组态逻辑图的测试，不依赖于真实的现场设备即可虚拟验证其正确性及完整性，缩减了调试工期，保证了设计过程的安全可靠性。