本发明公开了基于总线的数据快速传输系统及其方法，系统包括总线服务模块、总线同步模块、数据快速传输通道、安全区总线文件服务器、数据压缩模块、数据解压模块等，方法是文件进行压缩后通过数据快速传输通道送到安全区总线文件服务器，利用物理隔离装置将文件发送到目的方的安全区总线文件服务器，目的方的安全区总线文件服务器中的文件通过数据快速传输通道送到总线服务模块，总线服务模块查找目的方，将文件解压缩后发送到目的方。本发明的传输系统和传输方法极大提高了系统间网络的利用率，只要配置得当，理论上可传输任意大小的数据，相比在消息体中直接传输大容量数据，传输效率可提高20%-30%，具有广泛推广的价值。