本发明涉及一种立体图像数据压缩方法及系统，所述方法包括以下步骤：景深分类步骤，依据景深值采用聚类法将每帧图像的景深数据分解成若干景深块数据；数据压缩步骤，对每帧图像的各个景深块数据分别进行哈夫曼编码压缩；数据存储步骤，将经过哈夫曼编码压缩的数据存储成预设格式的文件。本发明通过先采用聚类法将每帧图像的景深数据分解成若干景深块数据，再对每帧图像的景深块数据进行哈夫曼编码压缩，从而本发明在保证图象质量无损的前提下，对景深信息进行更有效的压缩，以解决立体图像数据占用物理空间大的问题。