本发明属于医学断层成像技术领域，涉及一种用于漫射光断层成像的内窥式旋转探头，包括底板、外套、中空管、实心管、源光纤、探测光纤、小轴承、大轴承、大同步轮、小同步轮、步进电机、同步轮和同步带和步进电机，在实心管和中空管上分别设置有凹槽，源光纤固定在实心管的凹槽内，探测光纤固定在中空管的凹槽内，在实心管和中空管之间设置有小轴承，中空管和轴承座之间设置有大轴承；实心管的后端延伸到空心管的外部，在实心管的后端上固定有小同步轮，在中空管的后端上固定有大同步轮，大同步轮和小同步轮各由一个步进电机通过同步带驱动。本发明的旋转探头源光纤和探测光纤可以分别以任意角度旋转照射和探测，扫描方便灵活，成本较低。