本发明提供一种自助办税系统及其应用方法，系统由软件模块和硬件模块组成，软件模块包括数据处理模块、银联缴税模块、显示模块、打印控制模块、数据管理模块、配置获取模块、异常处理模块组成，硬件模块包括网络连接模块、二代身份证识别模块、计算资源模块、密码加密模块、发票打印和税票打印模块。本发明可以与现在已普及的银行自助取款机一样，把系统的终端机设置在市场密集区、银行、税务大厅等公共场所，使纳税人通过本系统实现社保费缴纳、发票打开、税款缴纳、凭证打印的目的，替代以及减轻了传统的税务人员人工输入的效率低下的工作方式，为征纳双方提供了方便，有利于提高效率。