本发明公开了一种USB设备的端口切换方法、系统和区分操作系统的方法，可在USB设备接入主机时，上报第一套MODS信息；主机将收到的第一套MODS信息修改为第二套MODS信息并存储；USB设备再次接入主机时，主机根据存储的第二套MODS信息自动发送切换命令，USB设备据此切换到正常工作模式。本发明方法和系统，在计算机主机上安装了驱动程序和管理软件(或者只安装其中之一)之后，如果将所述USB设备再次接入此计算机，则计算机会根据存储的第二套MODS信息快速发送特定命令，使得USB设备迅速切换到正常工作模式，提高了用户体验。