本发明公开了一种脂肪-芳香族共聚酯的制备方法，其组分由芳香族二元酸、脂肪族二元酸、脂肪族二元醇组成。其制备方法为：（a）酯化得到相应的酯化物；（b）预聚得相应预聚物；（c）缩聚反应；（d）缩聚结束后在反应物中加入多官能团环氧化合物，混合2-15分钟，制得脂肪-芳香族共聚酯。其有益效果：1．所述聚酯具有较高的耐热性能，熔点比较高，但是降解速度可控；2．采用的催化剂较少，生产过程中不会形成二氧化钛沉淀物，可以延长生产设备的维修更换周期；3．所述聚酯材料的纵向和横向撕裂强度都比较高；4．聚合物的结构容易控制，在反应的过程中不容易形成凝胶，加工成的膜材没有凝胶所形成的晶点。