本发明涉及一种厨余垃圾制备生物柴油的方法，厨余垃圾在微波加热下进行裂反应，与此同步进行酯化反应得到生物柴油产品。具体是将厨余垃圾与固体酸催化剂混合均匀进行微波加热脱水；再通入甲醇蒸气，并进行微波加热，收集所产生的蒸发气体进行精馏，收集精馏塔底部流出的组分，即得到生物柴油粗产品通过已知的分馏技术，即得到不同沸点范围的生物柴油产品。本发明将裂解和气相酯化有机结合在一起，并利用微波加热裂，缩短了加热时间，提高了生产效率，制备的生物柴油低温流动性好，制备工艺过程简单。