本发明公开了一种基于时间序列分析的风暴潮灾害预警系统，包括数据库服务器、预警预测模型分析、辅助决策系统展示、Web服务器以及管理用户。所述的数据库服务器存储历史监测资料数据、实时监测资料数据、基础地理信息资料数据库、应急预案资料数据、相关计算模型资料数据以及预警资料数据。所述的监测资料数据与预警资料数据均为时间序列数据。所述的预警预测模型分析主要是对数据进行预处理后，对时间序列数据进行分段线性表示达到维压缩的目的，进而与历史监测资料数据进行相似匹配，并根据相似匹配结果做出灾害预警。所述的辅助决策系统基于地理图形信息展示辅助决策信息，并通过部署的Web服务器来展示到管理用户客户端。