本发明公开了一种风力发电机转矩控制方法及系统，包括：在当前采样周期Ts的开始时刻，获取给定转矩和实时转矩，并根据所述给定转矩和所述实时转矩获取非零电压矢量；确定所述非零电压矢量的施加时间t1；在开始时刻至t1的时间内，向逆变器输入所述非零电压矢量以控制同步发电机，使所述同步发电机的转矩到达所述给定转矩；在t1至Ts的时间内，向所述逆变器施加零电压矢量以控制所述同步发电机。根据本发明，能够减小同步发电机的转矩脉动，延长同步发电机的运行寿命，保证整个风电机组的运行安全。