本发明公开了一种并行天文交叉证认方法，以集群系统环境作为执行环境，包括以下步骤：步骤一，搭建集群计算环境；步骤二，根据天文星表数据建立多维矩阵模型；步骤三，在集群间实现矩阵块分发；步骤四，进行分布式计算，对于集群系统中的每个节点，启动与该节点CPU数相同的线程数。对于需要并行证认的两个星表，以轮询的方式将编号相同的两个天文星表数据的文件分配给当前所在节点上的线程进行交叉证认计算，将结果写入临时文件；在所有线程的计算完成后，将所有临时文件汇总，得到最终证认结果。与现有技术相比，本发明提供一种易于操作，并行度高，可扩展性强的交叉证认方法，在保证证认正确性的前提下，能够提高交叉证认的性能。