本发明涉及一种具有抗菌功能的防水透气材料及其制备方法，属于服装、医护用品领域。具体步骤包括：步骤一、以多巴胺为改性剂，将防水透气的聚四氟乙烯(PTFE)薄膜进行单侧表面改性，使得该表面亲水性增加，并引入活性基团，另一侧仍然保持原有的高度防水的特性，得到单侧表面改性后的PTFE薄膜；步骤二、在步骤一所得的单侧表面改性后的PTFE薄膜表面固定化溶菌酶抗菌剂，就会得到抗菌材料，即PTFE抗菌薄膜。本发明成本低、抗菌剂添加量小、无安全隐患、而且制得的PTFE抗菌薄膜同时具有抗菌和防水透气、汽性，集多种功能于一体，无需分层便可解决问题。