本发明公开了一种电能质量综合控制器模糊-神经网络双闭环控制方法，包括电能质量综合控制器，所述电能质量综合控制器包括有源滤波器、固定电容器、晶闸管控制电抗器，所述有源滤波器、固定电容器、晶闸管控制电抗器依次并接入电网和与电网连接的负载之间，本发明通过将模糊控制和神经网路控制与注入式有源电力滤波器相结合进行谐波抑制，同时也将模糊控制和神经网路控制作用于晶闸管控制电抗器TCR和固定电容器FC组成的静止无功补偿器SVC，对其进行控制，实现无功动态补偿，同时引入双闭环的控制策略实现了对电力系统电能质量的优化。