本发明公开了一种动物呼吸道特异性启动子及其应用。本发明所提供的启动子，是下述a）或b）或c)的DNA片段：a）3′端至少含有序列表中序列1的第1701-2900位核苷酸序列，并且从序列1的第1701位开始、按照序列1的核苷酸序列向序列1的5′端延长，得到长度为1200bp至2900bp的任意一个DNA片段；所述DNA分子具有启动子功能；b）与a）限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同源性，且具有启动子功能的DNA片段；c）在严格条件下与a）或b）限定的核苷酸序列杂交，且具有启动子功能的DNA片段。本发明所提供的启动子在呼吸道细胞中特异表达目的基因，这对于培育抗呼吸系统传染病的转基因动物具有重要意义。