本发明公开了一种电力电子混合系统控制方法，包括电力电子混合控制系统，电力电子混合控制系统包括有源电力滤波器、静止无功补偿器，所述静止无功补偿器包括无源电力滤波器组和晶闸管控制电抗器，有源电力滤波器、无源电力滤波器组、晶闸管控制电抗器依次并接入电网和与电网连接的负载之间，通过无源电力滤波器和有源电力滤波器的联合使用，进行高压母线的谐波抑制，通过静止无功补偿器进行无功补偿，实现了延时补偿和在线控制，提高了控制精度，并改善了跟踪性能，降低了电网的电能损耗，净化了电网污染。